1897 begann man, den Höhbeck systematisch archäologisch zu erforschen. Bei den diversen darauf folgenden Grabungen wurden Besiedelungsspuren gefunden, die von der frühen Steinzeit bis ins späte Mittelalter und in die Neuzeit reichen.
2014 wurde die archäologische Abteilung neu gestaltet. Auf einer Zeitschiene werden dort Grabungsfunde aus der Region präsentiert und historische Siedlungszusammenhänge aufgezeigt. Die Ausstellung ist ein wichtiger Baustein innerhalb des Projektes „Zeitfenster Höhbeck“ des Biosphärenreservats Niedersächsische Elbtalaue. Sie ist allen Menschen besonders zu empfehlen, die mehr wissen wollen über die bewegte Geschichte des Höhbeck.